SMTL ID : 3k5s.1

Crystal structure of chicken T-cadherin EC1 EC2

Coordinates

PDB Format Compare

Method

X-RAY DIFFRACTION 2.90 Å

Oligo State

homo-dimer

Ligands

6 x CA: CALCIUM ION(Non-covalent)

CA.1: 6 residues within 4Å: Chain A: N.101, N.103, D.133, D.135, N.141, D.197 5 PLIP interactions: 5 interactions with chain A Metal complexes: A:N.103, A:D.133, A:D.133, A:N.141, A:D.197 CA.2: 7 residues within 4Å: Chain A: E.11, E.68, D.99, Q.100, D.102, N.103, D.135 5 PLIP interactions: 5 interactions with chain A Metal complexes: A:E.11, A:E.68, A:D.99, A:D.102, A:D.135 CA.3: 5 residues within 4Å: Chain A: E.11, N.12, D.66, E.68, D.102 4 PLIP interactions: 4 interactions with chain A Metal complexes: A:E.11, A:D.66, A:E.68, A:D.102 CA.4: 6 residues within 4Å: Chain B: N.101, N.103, D.133, D.135, N.141, D.197 5 PLIP interactions: 5 interactions with chain B Metal complexes: B:N.103, B:D.133, B:D.135, B:N.141, B:D.197 CA.5: 6 residues within 4Å: Chain B: E.11, E.68, D.99, Q.100, D.102, D.135 5 PLIP interactions: 5 interactions with chain B Metal complexes: B:E.68, B:D.99, B:Q.100, B:D.102, B:D.135 CA.6: 4 residues within 4Å: Chain B: E.11, D.66, E.68, D.102 4 PLIP interactions: 4 interactions with chain B Metal complexes: B:E.11, B:D.66, B:E.68, B:D.102

Links

RCSB   PDBe   PDBe-KB   PDBj   PDBsum   CATH   PLIP

Citation

Ciatto, C. et al., T-cadherin structures reveal a novel adhesive binding mechanism. Nat.Struct.Mol.Biol. (2010)

Release Date

2010-03-02

Peptides

Cadherin-13: AB

SMTL:PDB

SMTL Chain Id:
PDB Chain Id:

A
A

B
B

Cadherin-13