SMTL ID : 3p5n.1

Structure and mechanism of the S component of a bacterial ECF transporter

Coordinates

PDB Format Compare

Method

X-RAY DIFFRACTION 3.60 Å

Oligo State

homo-dimer

Ligands

2 x RBF: RIBOFLAVIN(Non-covalent)

RBF.1: 18 residues within 4Å: Chain A: K.32, Y.41, L.42, T.43, L.44, N.74, D.81, G.84, P.85, A.87, N.88, A.91, L.127, N.131, L.138, F.163, N.164, K.167 16 PLIP interactions: 16 interactions with chain A Hydrophobic interactions: A:Y.41, A:Y.41, A:L.42, A:L.138, A:L.138 Hydrogen bonds: A:K.32, A:T.43, A:L.44, A:N.74, A:D.81, A:D.81, A:G.84, A:N.131, A:N.164, A:N.164 pi-Stacking: A:F.163 RBF.2: 18 residues within 4Å: Chain B: K.32, Y.41, L.42, T.43, L.44, N.74, D.81, G.84, P.85, A.87, N.88, A.91, L.127, N.131, L.138, F.163, N.164, K.167 13 PLIP interactions: 13 interactions with chain B Hydrophobic interactions: B:Y.41, B:Y.41, B:L.138, B:L.138 Hydrogen bonds: B:K.32, B:T.43, B:L.44, B:N.74, B:D.81, B:N.131, B:N.164, B:N.164 pi-Stacking: B:F.163

Links

RCSB   PDBe   PDBe-KB   PDBj   PDBsum   CATH   PLIP

Citation

Zhang, P. et al., Structure and mechanism of the S component of a bacterial ECF transporter. Nature (2010)

Release Date

2010-11-03

Peptides

Riboflavin uptake protein: AB

SMTL:PDB

SMTL Chain Id:
PDB Chain Id:

A
A

B
B

Riboflavin uptake protein