SMTL ID : 3r4v.1

Structure of the phage tubulin PhuZ-GDP

Coordinates

PDB Format

Method

X-RAY DIFFRACTION 1.67 Å

Oligo State

monomer

Ligands

1 x GDP: GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE(Non-covalent)

GDP.1: 18 residues within 4Å: Chain A: G.11, G.12, T.13, N.16, S.89, G.92, G.93, S.94, G.95, V.118, A.120, E.122, N.126, N.155, Y.161, I.164, N.165 Ligands: MG.2 22 PLIP interactions: 22 interactions with chain A Hydrogen bonds: A:G.12, A:T.13, A:T.13, A:N.16, A:S.89, A:G.93, A:S.94, A:S.94, A:G.95, A:E.122, A:N.126, A:N.155, A:N.155, A:N.165, A:N.165 Water bridges: A:G.14, A:G.92, A:S.94, A:S.96, A:M.121 pi-Stacking: A:Y.161, A:Y.161

1 x MG: MAGNESIUM ION(Non-functional Binders)

MG.2: 1 residues within 4Å: Ligands: GDP.1 No protein-ligand interaction detected (PLIP)

Links

RCSB   PDBe   PDBe-KB   PDBj   PDBsum   CATH   PLIP

Citation

Kraemer, J.A. et al., A phage tubulin assembles dynamic filaments by an atypical mechanism to center viral DNA within the host cell. Cell(Cambridge,Mass.) (2012)

Release Date

2012-07-04

Peptides

Putative uncharacterized protein: A

SMTL:PDB

SMTL Chain Id:
PDB Chain Id:

A
A

Putative uncharacterized protein