SMTL ID : 4num.1 (1 other biounit)

Crystal structure of mouse N-cadherin EC1-2 A78SI92M

Coordinates

PDB Format Compare

Method

X-RAY DIFFRACTION 3.30 Å

Oligo State

homo-dimer

Ligands

6 x CA: CALCIUM ION(Non-covalent)

CA.1: 7 residues within 4Å: Chain A: N.102, N.104, D.134, D.136, N.142, D.194, L.203 5 PLIP interactions: 5 interactions with chain A Metal complexes: A:N.104, A:D.134, A:D.136, A:N.142, A:D.194 CA.2: 7 residues within 4Å: Chain A: E.11, E.69, D.100, M.101, D.103, N.104, D.136 5 PLIP interactions: 5 interactions with chain A Metal complexes: A:E.11, A:E.69, A:D.100, A:M.101, A:D.136 CA.3: 5 residues within 4Å: Chain A: E.11, N.12, D.67, E.69, D.103 4 PLIP interactions: 4 interactions with chain A Metal complexes: A:E.11, A:D.67, A:E.69, A:D.103 CA.4: 6 residues within 4Å: Chain B: N.102, N.104, D.134, D.136, N.142, D.194 5 PLIP interactions: 5 interactions with chain B Metal complexes: B:N.104, B:D.134, B:D.136, B:N.142, B:D.194 CA.5: 6 residues within 4Å: Chain B: E.11, E.69, D.100, M.101, D.103, D.136 6 PLIP interactions: 6 interactions with chain B Metal complexes: B:E.11, B:E.69, B:D.100, B:M.101, B:D.103, B:D.136 CA.6: 5 residues within 4Å: Chain B: E.11, N.12, D.67, E.69, D.103 3 PLIP interactions: 3 interactions with chain B Metal complexes: B:E.11, B:D.67, B:D.103

Links

RCSB   PDBe   PDBe-KB   PDBj   PDBsum   CATH   PLIP

Citation

Vendome, J. et al., Structural and energetic determinants of adhesive binding specificity in type I cadherins. Proc.Natl.Acad.Sci.USA (2014)

Release Date

2014-09-24

Peptides

Cadherin-2: AB

SMTL:PDB

SMTL Chain Id:
PDB Chain Id:

A
A

B
B

Cadherin-2

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