SMTL ID : 4rxh.1

Crystal Structure of Importin-alpha from Neurospora crassa complexed with SV40NLS

Coordinates

PDB Format Compare

Method

X-RAY DIFFRACTION 1.76 Å

Oligo State

monomer

Ligands

2 x LYS- LYS- ARG- LYS- VAL: Large T antigen(Non-covalent)

LYS-LYS-ARG-LYS-VAL.1: 18 residues within 4Å: Chain A: D.227, G.228, N.230, I.233, R.262, N.266, V.268, T.269, G.270, T.275, W.304, S.307, N.308, A.311, E.343, W.346, N.350, S.353 17 PLIP interactions: 17 interactions with chain A Hydrophobic interactions: A:W.304, A:A.311 Hydrogen bonds: A:D.227, A:T.269, A:T.275, A:S.307, A:S.307, A:N.308, A:N.308, A:N.308, A:T.310, A:S.353 Water bridges: A:D.227, A:G.228, A:W.346 Salt bridges: A:E.343 pi-Cation interactions: A:W.346 LYS-LYS-ARG-LYS-VAL.2: 24 residues within 4Å: Chain A: L.56, S.57, K.58, E.59, P.62, F.89, W.93, N.97, A.99, S.100, G.101, S.102, T.106, Q.132, W.135, G.138, N.139, G.142, D.143, W.178, N.182, R.185, D.217, W.220 23 PLIP interactions: 23 interactions with chain A Hydrophobic interactions: A:W.93, A:W.93, A:W.135, A:W.135, A:W.178, A:W.220 Hydrogen bonds: A:L.56, A:K.58, A:N.97, A:N.97, A:N.139, A:N.139, A:D.143, A:D.143, A:N.182, A:R.185 Water bridges: A:N.175, A:N.175, A:R.185, A:R.185, A:E.213, A:D.217, A:D.217

Links

RCSB   PDBe   PDBe-KB   PDBj   PDBsum   CATH   PLIP

Citation

Bernardes, N.E. et al., Structure of Importin-alpha from a Filamentous Fungus in Complex with a Classical Nuclear Localization Signal. Plos One (2015)

Release Date

2015-07-01

Peptides

Importin subunit alpha: A

SMTL:PDB

SMTL Chain Id:
PDB Chain Id:

A
B

Importin subunit alpha

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