SMTL ID : 5dn8.1

1.76 Angstrom Crystal Structure of GTP-binding Protein Der from Coxiella burnetii in Complex with GDP.

Coordinates

PDB Format

Method

X-RAY DIFFRACTION 1.76 Å

Oligo State

monomer

Ligands

2 x GDP: GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE(Non-covalent)

GDP.1: 16 residues within 4Å: Chain A: R.186, P.187, N.188, V.189, G.190, K.191, S.192, T.193, R.239, R.271, N.297, K.298, D.300, S.330, A.331, L.332 21 PLIP interactions: 21 interactions with chain A Hydrogen bonds: A:N.188, A:V.189, A:G.190, A:K.191, A:S.192, A:S.192, A:T.193, A:T.193, A:N.297, A:K.298, A:K.298, A:S.330, A:A.331, A:L.332 Water bridges: A:K.191, A:R.239, A:R.271 Salt bridges: A:K.191, A:R.239, A:R.239, A:D.300 GDP.2: 15 residues within 4Å: Chain A: R.13, P.14, N.15, V.16, G.17, K.18, S.19, T.20, K.96, N.122, K.123, D.125, A.148, A.149, A.150 22 PLIP interactions: 22 interactions with chain A Hydrogen bonds: A:R.13, A:N.15, A:V.16, A:G.17, A:K.18, A:S.19, A:S.19, A:T.20, A:T.20, A:N.122, A:K.123, A:A.150 Water bridges: A:K.18, A:K.18, A:K.18, A:S.19, A:S.19, A:G.61, A:K.123, A:K.123 Salt bridges: A:K.18, A:D.125

Links

RCSB   PDBe   PDBe-KB   PDBj   PDBsum   CATH   PLIP

Citation

Minasov, G. et al., 1.76 Angstrom Crystal Structure of GTP-binding Protein Der from Coxiella burnetii in Complex with GDP. To Be Published

Release Date

2015-10-14

Peptides

GTPase Der: A

SMTL:PDB

SMTL Chain Id:
PDB Chain Id:

A
A

GTPase Der