SMTL ID : 5hh0.1

Crystal structure of human Naa60 in complex with CoA

Coordinates

PDB Format

Method

X-RAY DIFFRACTION 1.60 Å

Oligo State

homo-dimer

Ligands

2 x COA: COENZYME A(Non-covalent)

COA.1: 18 residues within 4Å: Chain A: W.34, S.101, L.102, G.103, V.104, R.109, K.110, H.111, G.112, I.113, G.114, S.115, N.144, T.146, F.150, N.153, R.154 Chain B: I.168 26 PLIP interactions: 26 interactions with chain A Hydrophobic interactions: A:F.150 Hydrogen bonds: A:V.104, A:R.109, A:K.110, A:G.112, A:I.113, A:G.114, A:S.115, A:N.153, A:R.154 Water bridges: A:W.34, A:L.102, A:H.111, A:H.111, A:H.111, A:H.111, A:S.115, A:S.115, A:N.144, A:N.144, A:A.147, A:N.149, A:N.149, A:N.149 Salt bridges: A:R.154, A:R.154 COA.2: 18 residues within 4Å: Chain A: I.168 Chain B: W.34, S.101, L.102, G.103, V.104, R.109, K.110, H.111, G.112, I.113, G.114, S.115, N.144, T.146, F.150, N.153, R.154 26 PLIP interactions: 26 interactions with chain B Hydrophobic interactions: B:F.150 Hydrogen bonds: B:V.104, B:R.109, B:K.110, B:G.112, B:I.113, B:G.114, B:S.115, B:N.153, B:R.154 Water bridges: B:W.34, B:L.102, B:H.111, B:H.111, B:H.111, B:H.111, B:S.115, B:S.115, B:N.144, B:N.144, B:A.147, B:N.149, B:N.149, B:N.149 Salt bridges: B:R.154, B:R.154

Links

RCSB   PDBe   PDBe-KB   PDBj   PDBsum   CATH   PLIP

Citation

Chen, J.Y. et al., Structure and function of human Naa60 (NatF), a Golgi-localized bi-functional acetyltransferase. Sci Rep (2016)

Release Date

2016-09-14

Peptides

N-alpha-acetyltransferase 60: AB

SMTL:PDB

SMTL Chain Id:
PDB Chain Id:

A
A

B
A

N-alpha-acetyltransferase 60