SMTL ID : 5i4n.1

Crystal Structure of the E596A V617F Mutant JAK2 Pseudokinase Domain Bound to Mg-ATP

Coordinates

PDB Format Compare

Method

X-RAY DIFFRACTION 1.54 Å

Oligo State

monomer

Ligands

1 x ATP: ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE(Non-covalent)

ATP.1: 23 residues within 4Å: Chain A: L.17, Q.19, G.20, T.21, T.23, I.25, L.45, K.47, V.76, Q.92, E.93, F.94, V.95, G.98, S.99, T.102, N.139, K.143, N.144, L.146, G.167, R.181 Ligands: MG.2 30 PLIP interactions: 30 interactions with chain A Hydrogen bonds: A:T.21, A:T.21, A:T.23, A:Q.92, A:V.95, A:S.99, A:S.99, A:N.139, A:N.144, A:N.144, A:N.144, A:R.181 Water bridges: A:K.47, A:K.47, A:K.47, A:K.47, A:S.99, A:T.102, A:T.102, A:T.102, A:K.143, A:N.144, A:S.164, A:I.168, A:I.168, A:R.181 Salt bridges: A:K.47, A:K.143, A:K.143, A:K.143

1 x MG: MAGNESIUM ION(Non-covalent)

MG.2: 5 residues within 4Å: Chain A: K.47, K.143, N.144, S.164 Ligands: ATP.1 No protein-ligand interaction detected (PLIP)

1 x GOL: GLYCEROL(Non-functional Binders)

GOL.3: 6 residues within 4Å: Chain A: N.139, C.141, K.143, R.181, W.184, K.218 2 PLIP interactions: 2 interactions with chain A Water bridges: A:K.143, A:R.181

Links

RCSB   PDBe   PDBe-KB   PDBj   PDBsum   CATH   PLIP

Citation

Leroy, E. et al., Uncoupling JAK2 V617F activation from cytokine-induced signalling by modulation of JH2 alpha C helix. Biochem.J. (2016)

Release Date

2016-04-13

Peptides

Tyrosine-protein kinase JAK2: A

SMTL:PDB

SMTL Chain Id:
PDB Chain Id:

A
A

Tyrosine-protein kinase JAK2