SMTL ID : 5mfk.1 (1 other biounit)

Designed armadillo repeat protein YIII(Dq.V1)4CPAF in complex with peptide (KR)4

Coordinates

PDB Format Compare

Method

X-RAY DIFFRACTION 2.30 Å

Oligo State

monomer

Ligands

1 x LYS- ARG- LYS- ARG- LYS- ARG- LYS- ARG: (KR)4(Non-covalent)

LYS-ARG-LYS-ARG-LYS-ARG-LYS-ARG.1: 18 residues within 4Å: Chain A: S.75, G.76, W.110, N.114, S.117, G.118, N.120, I.123, K.148, E.149, W.152, N.156, S.159, G.160, I.165, W.194, N.198, S.201 24 PLIP interactions: 24 interactions with chain A Hydrophobic interactions: A:W.152, A:W.194 Hydrogen bonds: A:G.76, A:W.110, A:N.114, A:N.114, A:K.148, A:K.148, A:N.156, A:N.156, A:A.158, A:S.159, A:N.198, A:N.198, A:S.201, A:S.201 Water bridges: A:K.190 Salt bridges: A:E.149, A:E.149, A:E.191 pi-Cation interactions: A:W.110, A:W.110, A:W.194, A:W.194

Links

RCSB   PDBe   PDBe-KB   PDBj   PDBsum   CATH   PLIP

Citation

Hansen, S. et al., Curvature of designed armadillo repeat proteins allows modular peptide binding. J. Struct. Biol. (2018)

Release Date

2017-09-13

Peptides

YIII(Dq.V1)4CPAF: A

SMTL:PDB

SMTL Chain Id:
PDB Chain Id:

A
A

YIII(Dq.V1)4CPAF

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