SMTL ID : 5zvw.1

Structure of phAimR-Ligand

Coordinates

PDB Format Compare

Method

X-RAY DIFFRACTION 2.29 Å

Oligo State

monomer

Ligands

1 x SER- ALA- ILE- ARG- GLY- ALA: SER-ALA-ILE-ARG-GLY-ALA(Non-covalent)

SER-ALA-ILE-ARG-GLY-ALA.1: 25 residues within 4Å: Chain A: Y.153, L.156, F.161, M.191, L.192, N.195, N.199, R.221, F.225, L.228, T.229, N.232, M.261, G.264, A.265, F.268, K.288, Y.289, Q.291, L.292, N.321, F.325, Y.329, D.352, F.355 20 PLIP interactions: 20 interactions with chain A Hydrophobic interactions: A:L.156, A:L.192, A:M.261, A:F.268, A:Y.289, A:L.292, A:F.355 Hydrogen bonds: A:N.195, A:N.195, A:N.232, A:Q.291, A:N.321, A:N.321, A:N.321, A:Y.329 Water bridges: A:Q.86, A:N.199, A:Y.246 Salt bridges: A:R.221, A:D.352

Links

RCSB   PDBe   PDBe-KB   PDBj   PDBsum   CATH   PLIP

Citation

Dou, C. et al., Structural and functional insights into the regulation of the lysis-lysogeny decision in viral communities. Nat Microbiol (2018)

Release Date

2018-09-05

Peptides

AimR transcriptional regulator: A

SMTL:PDB

SMTL Chain Id:
PDB Chain Id:

A
A

AimR transcriptional regulator