SMTL ID : 7xpp.1

Crystal Structure of UDP-Glc/GlcNAc 4-Epimerase with NAD

Coordinates

PDB Format Compare

Method

X-RAY DIFFRACTION 2.60 Å

Oligo State

homo-dimer

Ligands

2 x NAD: NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE(Non-covalent)

NAD.1: 31 residues within 4Å: Chain A: G.13, G.16, Y.17, I.18, G.19, V.36, D.37, N.38, L.39, D.40, N.41, A.42, V.66, D.67, L.68, R.69, F.89, A.90, G.91, L.92, K.93, N.108, S.131, S.132, S.133, Y.157, K.161, Y.185, F.186, N.187, P.188 22 PLIP interactions: 22 interactions with chain A Hydrophobic interactions: A:N.38, A:A.90 Hydrogen bonds: A:Y.17, A:I.18, A:G.19, A:D.37, A:N.38, A:L.39, A:D.40, A:D.40, A:N.41, A:L.68, A:A.90, A:G.91, A:L.92, A:N.108, A:N.108, A:S.131, A:Y.157, A:K.161, A:N.187 Salt bridges: A:K.93 NAD.2: 28 residues within 4Å: Chain B: G.13, A.15, G.16, Y.17, I.18, D.37, N.38, L.39, D.40, N.41, A.42, V.66, D.67, L.68, R.69, F.89, A.90, G.91, L.92, K.93, N.108, S.131, S.133, Y.157, K.161, Y.185, N.187, P.188 20 PLIP interactions: 20 interactions with chain B Hydrophobic interactions: B:D.40 Hydrogen bonds: B:I.18, B:D.37, B:N.38, B:N.38, B:L.39, B:D.40, B:N.41, B:N.41, B:A.42, B:L.68, B:G.91, B:N.108, B:S.131, B:Y.157, B:Y.157, B:K.161, B:Y.185, B:N.187 Salt bridges: B:K.93

Links

RCSB   PDBe   PDBe-KB   PDBj   PDBsum   CATH   PLIP

Citation

Zhou, Y. et al., A maize epimerase modulates cell wall synthesis and glycosylation during stomatal morphogenesis. Nat Commun (2023)

Release Date

2023-05-24

Peptides

UDP-glucose 4-epimerase: AB

SMTL:PDB

SMTL Chain Id:
PDB Chain Id:

A
B

B
A

UDP-glucose 4-epimerase

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