SMTL ID : 2aw6.1

Structure of a bacterial peptide pheromone/receptor complex and its mechanism of gene regulation

Coordinates

PDB Format Compare

Method

X-RAY DIFFRACTION 3.00 Å

Oligo State

homo-dimer

Ligands

2 x LEU- VAL- THR- LEU- VAL- PHE- VAL: peptide(Non-covalent)

LEU-VAL-THR-LEU-VAL-PHE-VAL.1: 21 residues within 4Å: Chain B: K.70, K.79, S.111, G.115, S.118, E.154, S.157, N.158, N.161, D.185, T.189, T.192, K.195, N.196, T.199, I.200, Y.232, E.235, S.275, L.276, E.279 22 PLIP interactions: 22 interactions with chain B Hydrophobic interactions: B:K.79, B:N.158, B:N.161, B:D.185, B:T.189, B:T.192, B:T.199, B:I.200, B:L.276, B:L.276 Hydrogen bonds: B:K.70, B:E.154, B:N.158, B:N.158, B:K.195, B:K.195, B:N.196, B:N.196, B:T.199, B:T.199 Salt bridges: B:K.70, B:K.79 LEU-VAL-THR-LEU-VAL-PHE-VAL.2: 21 residues within 4Å: Chain A: K.70, K.79, S.111, G.115, S.118, E.154, S.157, N.158, N.161, D.185, T.189, T.192, K.195, N.196, T.199, I.200, Y.232, E.235, S.275, L.276, E.279 23 PLIP interactions: 23 interactions with chain A Hydrophobic interactions: A:K.79, A:E.154, A:N.161, A:D.185, A:T.189, A:T.199, A:I.200, A:L.276 Hydrogen bonds: A:K.70, A:K.79, A:S.111, A:E.154, A:E.154, A:E.154, A:N.158, A:N.158, A:K.195, A:K.195, A:N.196, A:T.199, A:E.235 Salt bridges: A:K.70, A:K.79

Links

RCSB   PDBe   PDBe-KB   PDBj   PDBsum   CATH   PLIP

Citation

Shi, K. et al., Structure of peptide sex pheromone receptor PrgX and PrgX/pheromone complexes and regulation of conjugation in Enterococcus faecalis. Proc.Natl.Acad.Sci.Usa (2005)

Release Date

2005-12-06

Peptides

PrgX: AB

SMTL:PDB

SMTL Chain Id:
PDB Chain Id:

A
A

B
B

PrgX

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