SMTL ID : 1ztw.1

d(CTTAATTCGAATTAAG) complexed with Moloney Murine Leukemia Virus Reverse Transcriptase catalytic fragment

Coordinates

PDB Format

Method

X-RAY DIFFRACTION 1.80 Å

Oligo State

homo-dimer

Ligands

2 x DC- DT- DT- DA- DA- DT- DT- DC: CTTAATTC(Non-covalent)

DC-DT-DT-DA-DA-DT-DT-DC.1: 13 residues within 4Å: Chain A: Y.41, L.76, R.93, K.97 Ligands: DG-DA-DA-DT-DT-DA-DA-DG.2, DG-DA-DA-DT-DT-DA-DA-DG.2, DG-DA-DA-DT-DT-DA-DA-DG.2, DG-DA-DA-DT-DT-DA-DA-DG.2, DG-DA-DA-DT-DT-DA-DA-DG.2, DG-DA-DA-DT-DT-DA-DA-DG.2, DG-DA-DA-DT-DT-DA-DA-DG.2, DG-DA-DA-DT-DT-DA-DA-DG.2, DG-DA-DA-DT-DT-DA-DA-DG.4 Protein-ligand interaction information (PLIP) not available DC-DT-DT-DA-DA-DT-DT-DC.3: 13 residues within 4Å: Chain B: Y.41, L.76, R.93, K.97 Ligands: DG-DA-DA-DT-DT-DA-DA-DG.2, DG-DA-DA-DT-DT-DA-DA-DG.4, DG-DA-DA-DT-DT-DA-DA-DG.4, DG-DA-DA-DT-DT-DA-DA-DG.4, DG-DA-DA-DT-DT-DA-DA-DG.4, DG-DA-DA-DT-DT-DA-DA-DG.4, DG-DA-DA-DT-DT-DA-DA-DG.4, DG-DA-DA-DT-DT-DA-DA-DG.4, DG-DA-DA-DT-DT-DA-DA-DG.4 Protein-ligand interaction information (PLIP) not available

2 x DG- DA- DA- DT- DT- DA- DA- DG: GAATTAAG(Non-covalent)

DG-DA-DA-DT-DT-DA-DA-DG.2: 17 residues within 4Å: Chain A: L.76, Q.90, D.91, L.92, R.93, N.96, G.168 Ligands: DC-DT-DT-DA-DA-DT-DT-DC.1, DC-DT-DT-DA-DA-DT-DT-DC.1, DC-DT-DT-DA-DA-DT-DT-DC.1, DC-DT-DT-DA-DA-DT-DT-DC.1, DC-DT-DT-DA-DA-DT-DT-DC.1, DC-DT-DT-DA-DA-DT-DT-DC.1, DC-DT-DT-DA-DA-DT-DT-DC.1, DC-DT-DT-DA-DA-DT-DT-DC.1, DC-DT-DT-DA-DA-DT-DT-DC.3, DG-DA-DA-DT-DT-DA-DA-DG.4 Protein-ligand interaction information (PLIP) not available DG-DA-DA-DT-DT-DA-DA-DG.4: 17 residues within 4Å: Chain B: L.76, Q.90, D.91, L.92, R.93, N.96, G.168 Ligands: DC-DT-DT-DA-DA-DT-DT-DC.1, DG-DA-DA-DT-DT-DA-DA-DG.2, DC-DT-DT-DA-DA-DT-DT-DC.3, DC-DT-DT-DA-DA-DT-DT-DC.3, DC-DT-DT-DA-DA-DT-DT-DC.3, DC-DT-DT-DA-DA-DT-DT-DC.3, DC-DT-DT-DA-DA-DT-DT-DC.3, DC-DT-DT-DA-DA-DT-DT-DC.3, DC-DT-DT-DA-DA-DT-DT-DC.3, DC-DT-DT-DA-DA-DT-DT-DC.3 Protein-ligand interaction information (PLIP) not available

Links

RCSB   PDBe   PDBe-KB   PDBj   PDBsum   CATH   PLIP

Citation

Goodwin, K.D. et al., A host-guest approach for determining drug-DNA interactions: an example using netropsin. Nucleic Acids Res. (2005)

Release Date

2005-08-30

Peptides

Reverse transcriptase: AB

SMTL:PDB

SMTL Chain Id:
PDB Chain Id:

A
A

B
A

Reverse transcriptase

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