SMTL ID : 5oa1.1

RNA polymerase I pre-initiation complex

Coordinates
PDB Format
Method
ELECTRON MICROSCOPY
Oligo State
hetero-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-2-1-1-1-1-1-mer
Ligands
2 x ALA- ALA- ALA- ALA- ALA- ALA- ALA- ALA- ALA: ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA(Non-functional Binders)
7 x ZN: ZINC ION(Non-covalent)
Links
RCSB   PDBe   PDBj   PDBsum   CATH   PLIP
Citation
Sadian, Y. et al., Structural insights into transcription initiation by yeast RNA polymerase I. EMBO J. (2017)
Release Date
2017-07-26
Peptides
DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA190: A
DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA135: B
DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1: C
DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA14: D
DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1: E
DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2: F
DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43: G
DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3: H
DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA12: I
DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5: J
DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2: K
DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4: L
DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49: M
DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA34: N
RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3: O
RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN7: R
RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN6: S
RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN11: T
ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA: U
ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA: V
ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA: W
ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA: X1
ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA: Y0
ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA: Z
ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA: 2
ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA: 3
ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA: 4
ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA: 5
SMTL:PDB
SMTL Chain Id:
PDB Chain Id:
A
A
B
B
C
C
D
D
E
E
F
F
G
G
H
H
I
I
J
J
K
K
L
L
M
M
N
N
O
O
R
U
S
V
T
W
U
1
V
2
W
4
X
5
1
Q
Y
6
0
8
Z
7
2
P
3
Z
4
Y
5
R

DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA190

DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA135

DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1

DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA14

DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1

DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2

DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43

DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3

DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA12

DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5

DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2

DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4

DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49

DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA34

RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3

RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN7

RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN6

RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN11

ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA

ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA

ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA

ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA

Toggle Identical (X1)

ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA

Toggle Identical (Y0)

ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA

ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA

ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA

ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA

ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA-ALA

Related Entries With Identical Sequence

1dzf.1 | 1i3q.1 | 1i50.1 | 1i50.2 | 1i6h.1 | 1k83.1 | 1nik.1 | 1r5u.1 | 1r9s.1 | 1r9t.1 | 1sfo.1 | 1twa.1 | 1twc.1 | 1twf.1 | 1twf.2 | 1twg.1 | 1twg.2 | 1twg.3 | 1twh.1 | 1wcm.1 | 1y1v.1 | 1y1w.1 | 1y77.1 | 2b63.1 | 2b8k.1 | 2e2h.1 | 2e2i.1 | 2e2j.1 | 2ja5.1 | 2ja6.1  more...